Менло-Парк (штат Калифорния, США) – 12 апеля – Компания Personalis, Inc. (Nasdaq: PSNL), лидер в области передовой геномики для прецизионной онкологии, сообщила сегодня о публикации в издании Nature Communications своего исследования под названием "Алгоритм машинного обучения с субклональной чувствительностью выявляет Потеря гетерозиготности лейкоцитарных антигенов человека (HLA LOH) позволяет раковым клеткам избегать иммунного распознавания путем удаления HLA-аллелей, что приводит к подавлению презентации опухолевых неоантигенов. Несмотря на ее важность для ответа на иммунотерапию, существует мало методов выявления HLA LOH, и их точность недостаточно хорошо изучена. Кроме того, точное определение HLA LOH на основе данных секвенирования представляет интерес, учитывая все более широкое распространение молекулярного профилирования опухолей.
В исследовании Personalis подробно описана разработка DASH (Deletion of Allele-Specific HLAs), нового алгоритма на основе машинного обучения для обнаружения HLA LOH по данным парного секвенирования опухолевых и нормальных клеток. Благодаря валидации с использованием смесей клеточных линий и цифровой ПЦР для конкретного пациента, исследование демонстрирует более высокую чувствительность обнаружения HLA LOH с помощью DASH в сравнении с ранее представленными инструментами и прокладывает путь к клиническому применению этого алгоритма. Используя DASH для 610 пациентов с 15 типами опухолей, исследование показало, что HLA LOH затрагивает большой процент пациентов, включая пациентов с аденокарциномой немелкоклеточного рака легких (НМРЛ-A) (24 процента), раком шейки матки (38 процентов) и плоскоклеточной карциномой головы и шеи (HNSCC) (40 процентов). Кроме того, исследование показало повышенные уровни HLA LOH по сравнению с общегеномной LOH, а также корреляции между экспрессией CD274 (PD-L1) и статусом микросателлитной нестабильности, что позволяет предположить, что HLA LOH является ключевой стратегией иммунной резистентности.
"Точное определение HLA LOH имеет решающее значение для его использования в качестве биомаркера для иммунотерапии рака. Данное исследование демонстрирует способность DASH с высокой степенью чувствительности выявлять субклональные события в образцах с низкой чистотой опухоли, что позволяет проводить комплексное профилирование широко распространенной HLA LOH с охватом различных типов опухолей. ", - сказал Ричард Чен (Richard Chen), доктор медицины, главный медицинский директор и старший вице-президент по исследованиям и разработкам компании Personalis. – "Эти выявленные с помощью DASH события HLA LOH, интегрированные в NeXT Platform компании Personalis, являются ключевым вкладом в наш составной мультиомический биомаркер NEOPS™ для лучшего прогнозирования ответа на иммунотерапию".
Потеря гетерозиготности лейкоцитарных антигенов человека (HLA LOH) позволяет раковым клеткам избегать иммунного распознавания путем удаления HLA-аллелей, что приводит к подавлению презентации опухолевых неоантигенов. Несмотря на ее важность для ответа на иммунотерапию, существует мало методов выявления HLA LOH, и их точность недостаточно хорошо изучена. Кроме того, точное определение HLA LOH на основе данных секвенирования представляет интерес, учитывая все более широкое распространение молекулярного профилирования опухолей.
В исследовании Personalis подробно описана разработка DASH (Deletion of Allele-Specific HLAs), нового алгоритма на основе машинного обучения для обнаружения HLA LOH по данным парного секвенирования опухолевых и нормальных клеток. Благодаря валидации с использованием смесей клеточных линий и цифровой ПЦР для конкретного пациента, исследование демонстрирует более высокую чувствительность обнаружения HLA LOH с помощью DASH в сравнении с ранее представленными инструментами и прокладывает путь к клиническому применению этого алгоритма. Используя DASH для 610 пациентов с 15 типами опухолей, исследование показало, что HLA LOH затрагивает большой процент пациентов, включая пациентов с аденокарциномой немелкоклеточного рака легких (НМРЛ-A) (24 процента), раком шейки матки (38 процентов) и плоскоклеточной карциномой головы и шеи (HNSCC) (40 процентов). Кроме того, исследование показало повышенные уровни HLA LOH по сравнению с общегеномной LOH, а также корреляции между экспрессией CD274 (PD-L1) и статусом микросателлитной нестабильности, что позволяет предположить, что HLA LOH является ключевой стратегией иммунной резистентности.
"Точное определение HLA LOH имеет решающее значение для его использования в качестве биомаркера для иммунотерапии рака. Данное исследование демонстрирует способность DASH с высокой степенью чувствительности выявлять субклональные события в образцах с низкой чистотой опухоли, что позволяет проводить комплексное профилирование широко распространенной HLA LOH с охватом различных типов опухолей. ", - сказал Ричард Чен (Richard Chen), доктор медицины, главный медицинский директор и старший вице-президент по исследованиям и разработкам компании Personalis. – "Эти выявленные с помощью DASH события HLA LOH, интегрированные в NeXT Platform компании Personalis, являются ключевым вкладом в наш составной мультиомический биомаркер NEOPS™ для лучшего прогнозирования ответа на иммунотерапию".
Personalis
Personalis, Inc. является лидером в области передовой геномики рака для создания нового поколения прецизионных методов лечения и диагностики рака.
Заявления прогнозного характера
Все заявления в данном пресс-релизе, не относящиеся к свершившимся фактами, являются "заявлениями прогнозного характера" согласно тому, как это понятие определяется законодательством США о ценных бумагах. К ним относятся заявления, касающиеся атрибутики или преимуществ платформы ImmunoID NeXT®, алгоритма SHERPA® или биомаркера NEOPS, деловых возможностей компании Personalis, её лидерства, планов или ожиданий, а также других будущих событий. Такие заявления прогнозного характера сопряжены с рисками и неопределённостями, которые могут стать причиной того, что фактические результаты будут существенно отличаться от любых предполагаемых результатов или ожиданий, выраженных или подразумеваемых в таких заявлениях прогнозного характера. Факторы, которые могут существенно повлиять на фактические результаты, указаны в документации Personalis, представляемой в Комиссию по ценным бумагам и биржам США, в том числе в самых последних отчётах компании по формам 8-K, 10-K и 10-Q, в регистрационном заявлении компании по форме S-3, поданном 30 декабря 2020 года, и в дополнительном проспекте компании, поданном 3 января 2022 года, и включают те, что перечислены под заголовком "Факторы риска". Personalis не берет на себя никаких обязательств по обновлению таких заявлений прогнозного характера.
Контактная информация:
Контакт для инвесторов, Personalis:
Caroline Corner
. |
